Fakultas Teknik Universitas Muhammadiyah Yogyakarta memiliki beberapa laboratorium sebagai berikut:
Laboratorium Teknik Sipil
Teknik Sipil Universitas Muhammadiyah Yogyakarta memiliki beberapa laboratorium yang menunjang kegiatan perkuliahan mahasiswa, antara lain :
- Laboratorium Struktur dan Bahan Konstruksi
- Laboratorium Transportasi dan Jalan Raya
- Laboratorium Keairan dan Lingkungan,
- Laboratorium Geoteknik
- Laboratorium Komputasi
Laboratorium Teknik Elektro
Teknik Elektro Universitas Muhammadiyah memiliki beberapa laboratorium yang menunjang kegiatan perkuliahan mahasiswa, antara lain:
- Laboratorium Jaringan Komputer
- Laboratorium Komputer dan Perancangan
- Laboratorium Instrumentasi dan Kendali
- Laboratorium Instalasi Listrik
- Laboratorium Telekomunikasi dan Mikroprosesor
Laboratorium Teknik Mesin
Teknik Mesin Universitas Muhammadiyah Yogyakarta memiliki beberapa laboratorium yang menunjang kegiatan perkuliahan mahasiswa, antara lain:
- Laboratorium Fabrikasi Logam
- Laboratorium Prestasi Mesin
- Laboratorium CNC
- Laboratorium Fenomena Dasar Mesin
- Laboratorium Mekanika dan Kendali
- LAB (D) Laboratorium Sistem Operasi dan Optimasi Komputer (Operating Systems and Computer Optimization Laboratory)
- LAB (E) Laboratorium Multimedia Lanjut (Advanced Multimedia Laboratory)
- LAB (G) Laboratorium Perancangan antarmuka manusia dan komputer
(Human Computer Interaction Laboratory) - LAB (H) Laboratorium Implementasi Solusi BI
Data warehouse and Business Intelligence Laboratory
Laboratorium Teknologi Informasi
Teknologi Informasi Universitas Muhammadiyah Yogyakarta memiliki beberapa laboratorium yang menunjang kegiatan perkuliahan mahasiswa, antara lain:
- LAB (A) Laboratorium Pemrograman dan Basis Data (Programming and Databases Laboratory)
- LAB (B) Laboratorium Jaringan Komputer dan Komputasi Awan (Networking and Cloud Computing Laboratory)
- LAB (C) Laboratorium Sistem Terintegrasi dan Keamanan (Cyber Integrated Systems and Cyber Security) Laboratory